Kuroigan to DouJutsu specyficzne dla członków klanu Muramasa (^^). Dosłownie oznacza "Czarne oczy" (kuroi-gan) i wywodzi się od Byakugan. Jest skuteczną formą obrony przed Sharingan i Byakugan, od którego się wywodzi. Wytwarza wokół ninjy sferę mrocznej aury, która wraz z Chakrą wycieka przez małe otwory w ciele.

Uaktywnia się gdy ninja zamknie oczy i skoncentruje się.
Spod powiek wypływa wtedy strużka krwi. Jednocześnie, ninję zaczyna otaczać ciemna mgiełka (unoszący się w powietrzu popiół) tak, że widać tylko niektóre części ciała. Bariera dymna zasłania ruchy dłoni oraz stóp. Na wyższych poziomach ciało produkuje jej więcej oraz zmniejsza koszt zużycia Chakry.
Używający traci chwilowy kontakt ze swoim ciałem w momencie zamknięcia oczy.
Spogląda wtedy na siebie z góry, jakby dodatkowymi oczami zawieszonymi w przestrzeni kilka metrów za sobą. Nazywa się je wewnętrznymi oczami. Nie rozróżniają kolorów a ich zasięg pozostawia wiele do życzenia. Z tego stanu, powrócić do ciała można natychmiastowo.

Prawdopodobnie niemowlęta trzymane są w ciemnościach przez dłuższy okres życia by przyswoić sobie tą niezwykłą zdolność. Ich białka mają czarny kolor a same źrenice rzadko przybierają inną barwę niż czerwień. W zamian za to mają wyostrzony zmysł słuchu. Potrafią śledzić ruch przedmiotów bez potrzeby otwierania wewnętrznych oczu.

Zamknięcie oczu sprawia, że Sharingan staje się bezużyteczne gdyż nie może skopiować żadnych technik. Nawet obserwując ruchy rąk - które są zasłaniane przez ciemną mgiełkę.
Byakugan natomiast widzi tylko aurę ninjy, która skutecznie zniekształca wokół niego obraz.

Kuroigan jest także doskonałą obroną przeciwko Genjutsu oraz Taijutsu.
- Lepszy zmysł słuchu. Szybsza reakcja;
- Wewnętrzne oczy rozróżniają iluzję;
- Unosząca się wokół postaci mgła popielna zwiększa możliwość uniku;
- Broni przed pozostałymi Doujutsu;
- Zwiększa efektywność i zasięg cienistych (Kage) Jutsu;
- Stabilizuje i przyspiesza przepływ Chakry.

Niestety, ma także wady:
- Główna siła obrony polega na walce z przeciwnikami posiadającymi Doujutsu;
- Bez odpowiednich Ninjutsu jest bezużyteczny w ataku;
- Ograniczony limit siły oraz wytrzymałości;
- Ciało jest podatniejsze na obrażenia;
- Najsłabszym punktem są ataki dźwięku, które ogłuszają a nawet paraliżują ninję posiadającego Kuroigan;
- Nie może być używany przy małych ilościach Chakry - dla poziomu pierwszego i drugiego 1/3, dla trzeciego 1/4 - wtedy przepływ Chakry w ciele jest niepełny i Doujutsu staje się wadliwe. Używając Kuroigan w momencie gdy liczba przekracza wymaganą granicę, ninja otrzymuje cielesne obrażenia na organy wewnętrzne. Gdy Chakra wynosi zero, ninja umiera (dokładnie: ciało ulega natychmiastowemu spaleniu i obróceniu się w popiół).

Posiada trzy poziomy.
Wraz z każdym poziomem wymagana jest większa liczba otworów w ciele.
Pierwsze siedem otworów zostaję wykonane przez rodziców dziecka.
Następne - adept musi sobie sam przekłuć.

Poziom 1 - Kuroigan
Cienista Aura okrywa dłonie i stopy oraz kolana i szyję.
Spod oczu wypływa strużka krwi.
Koszty zużycia Chakry spadają o 10%
Liczba otworów w ciele - 7.
Zakres widzenia wewnętrznych oczu - 3 metry (promień).
Nie można używać gdy ma się mniej niż 1/3 maksymalnej Chakry.

Poziom 2 - Kuroigan
Cienista Aura okrywa całe ciało z wyjątkiem twarzy.
Spod oczu oraz z nozdrzy wypływa strużka krwi.
Koszty zużycia Chakry spadają o 25%
Liczba otworów w ciele - 49.
Zakres widzenia wewnętrznych oczu - 7 metrów (promień).
Nie można używać gdy ma się mniej niż 1/3 maksymalnej Chakry.

Poziom 3 – Kuroimegan
Cienista Aura okrywa całe ciało.
Krew wypływa z wszystkich otworów, miesza się z popiołem i powstaje Krwisto-czerwoną zbroję* (nie znam japońskiej nazwy), który pokrywa skórę ninjy.
Koszty zużycia Chakry spadają o 50%
Liczba otworów w ciele - 343.
Zakres widzenia wewnętrznych oczu - 21 metrów (promień).
Nie można używać gdy ma się mniej niż 1/4 maksymalnej Chakry.